计划于 2024 年合并的东京工业大学和东京医科齿科大学决定将新大学命名为“东京理科大学（暂定名）”。简称：科学大学。英文表示法为“Institute of Science Tokyo”，缩写目前正在调整中。这将是自2003年东京水产大学和东京商业海洋大学合并组建东京海洋科技大学以来，首次通过整合以新名称重启国立大学。
据东京工业大学介绍，两校将于2022年11月至12月向校内外广泛征集新校名。结果，征集了6,000多份提案，整合筹备委员会下设的名称审核工作组对提案进行了讨论，做出了最终决定。
新校名包括校名开头的“Tokyo”，强调它是一所立足于东京的大学，并铭记新大学以科学发展为己任，努力开辟充满活力的未来. ，并包括“科学”一词。 “科学”不仅包括两所大学的专业领域和未知领域，还包括人文社会科学的视角。此外，为了通过努力让科学成为一种文化来获得社会的理解和期望，据说还考虑到让人们熟悉和容易记住它。
需要说明的是，目前是暂定名称，具体名称的决定需要在大学设置和学校法人审议会以及国立大学法人法的修改（国会审议）等程序中进行。
