东邦大学的一个研究小组与国立技术评估研究所生物技术中心合作,发现了稀有放线菌(Actinoplanes chiromycinicus)的新种TPMA0078T。该菌株是从东京新宿的土壤中分离出来的,被发现能产生具有很强抗菌活性的克罗霉素。
放线菌是一类革兰氏阳性细菌,其基因组 DNA 中含有高含量的 GC(鸟嘌呤、胞嘧啶)。典型的放线菌拉长菌丝并分枝并形成孢子,表现出与丝状真菌相似的多种形态。它主要从土壤中分离出来,但近年来也有很多从植物和海洋环境中分离出来的报道。此外,放线菌产生多种次生代谢产物,例如不参与生命维持或生长和增殖的抗生素。据称,迄今为止已发现一万多种源自微生物的抗生素化合物,其中三分之二源自放线菌。
在寻找源自放线菌的生物活性物质时,研究小组从东京新宿的土壤中分离出了TPMA0078T,它能形成橙色菌落。通过与相关物种的基因组序列对比分析,对形态、培养特征、化学分类特征等进行详细分析,揭示该菌株为珍稀放线菌属游动菌属的新种。
此外,还证实该菌株产生抑制细菌蛋白质合成的抗生素克罗霉素,并且基因组分析信息表明它具有除了克霉素之外还可以产生多种抗生素的生物合成基因。
这项研究的结果不仅有望加深对放线菌多样性的理解,而且有助于确保可用于药物种子化合物开发的生物资源,包括遗传信息。