Yasushi Ishihama 教授和京都大学药学研究生院的同事们开发了蛋白质组集成数据库 jPOST,并向全世界发布。该数据库由以京都大学为中心的全日本系统开发,包括熊本大学、九州大学、新泻大学、信息系统研究机构和科学技术促进机构(JST)。
Proteome意为“所有表达的蛋白质”,是一组“直接承担生命活动”的分子,因此主要在药物发现领域引起了极大的关注,国际上进行了各种大规模的研究。 .蛋白质组数据以数据库的形式主要在欧美各地积累,国际合作也在进行中,但目前日本还没有类似的数据库,国内数据必须注册到海外数据库。说他没听懂。
本次开发的jPOST数据仓库系统(repository是数据的集中存储)是对分散在日本和海外的各种蛋白质组数据进行标准化、集成、集中管理。该系统构建了世界上第一个横断面蛋白质组综合数据库,其中包含各种物种(人类、动物、植物、酵母、细菌等)、翻译后修饰(磷酸化等)和绝对表达水平的信息。据说这是。
jPOST是亚洲-大洋洲地区第一个国际标准蛋白质组数据存储库,在2016年国际人类蛋白质组组织/蛋白质组学标准化倡议大会(比利时)上,ProteomeXchange Consortium(PXC)提供了一个国际标准数据存储库系统,Membership被宣布。未来,有可能从世界各地(主要是亚洲)收集蛋白质组数据到 jPOST。