7月20日,东海大学医学部今西典教授领导的研究小组宣布,他已成功开发出可应用于细菌感染诊断的快速基因组分析系统。它可以用一台便携式测序仪和两台笔记本电脑进行分析,在2小时内可以鉴定出基因组序列数据库中登记的8多种细菌种类和菌株,因此有望在灾区和热带地区发挥作用。

 肺炎、食物中毒等细菌性传染病是世界范围内的重大问题。致病菌种类很多,细菌感染通过细菌培养方法确诊。但测定需要1~2天时间,且由于存在难治菌和培养条件不匹配,菌种鉴定难度大。因此,过去常常根据患者的经验给患者服用抗菌药物。认为这会延迟有效药物的给药,促进耐药菌的出现。

 这一次,研究小组创建了一个由便携式 DNA 测序仪 MinION 和两台笔记本电脑组成的基因组分析系统。这用于检查多个最近的混合 DNA 并验证它们的准确性和时间。结果发现,可以在2小时内读取DNA序列并鉴定其中包含的主要细菌。当实际使用同一系统分析脓胸患者的胸腔积液样本时,可以快速检测出被认为是病因的厌氧菌。然而,发现细菌的组成有进一步改进的空间,因为它需要大量的计算时间。

该系统的进一步发展将导致选择合适的抗菌剂和抑制耐药细菌的出现。

纸张信息:[科学报告] 使用基于纳米孔的测序仪和笔记本电脑进行快速细菌成分分析的便携式系统

东海大学

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