校际研究所是“国立、公立、私立大学联合使用研究所”（文部科学省）。它为全国研究人员提供了共同使用和共同研究的场所，是从事个别大学难以进行的研究和创造新想法的核心基地。目前，日本国立天文台、粒子与核研究所等19个设施和研究机构横跨文化、自然科学、能源和信息领域。

　在这个提案中，为了保持和加强诺贝尔奖级别的高水平研究能力，迫切需要推进大型项目，重要的是要有一个系统来实现个人研究的飞跃和发展研究。在国家层面超越大学的界限……因此，有必要改变目前大学合用事业单位的组织结构和设置状态，转变为与时代相适应的结构，同时设计国立大学与事业单位相结合的整个大学体系。

　与此同时，他指出了大学间研究机构面临的问题和努力。首先，向各大学传播信息的能力较弱，我们要求开展数据公开、研究成果权利处理、明确联合研究和设备使用的采用要求等宣传活动和制度建设。在人力资源开发方面，有必要利用与国内外研究机构的网络，振兴研究，提高人力资源的流动性。在财政方面，在减少运营费用补贴的同时，我们要求通过构建新的制度来实现财政资源的多元化，文部科学省将优化预算超出各相关局。