成百上千种细菌生​​活在人体肠道中,形成肠道菌群。虽然噬菌体被认为对肠道菌群的形成和活性有很强的影响,但关于它们的多样性和生态系统还有很多未知数,它们在人体肠道中也被称为“暗物质”。

 这一次,来自早稻田大学、东京医科大学和国家全球健康与医学中心 (NCGM) 的研究人员收集了日本 4D(疾病药物饮食日常生活)微生物组项目中注册的 4,198 名日本人的大规模鸟枪宏基因组数据。通过分析,我们试图阐明生活在人类肠道中的噬菌体的全貌。

 通过构建原始信息分析管道并将其应用于宏基因组数据,我们成功识别了1,000多种噬菌体的基因组信息。有趣的是,还发现了许多以前未知的新型噬菌体群,尽管它们在人体肠道中含量丰富。

 此外,为了阐明影响肠道噬菌体群落的因素,我们进行了综合关联分析,发现年龄、性别、饮食习惯、生活方式、疾病和药物摄入等多种因素都与肠道相关。噬菌体群落。发现与噬菌体群落有关这些因素中的大部分也与影响肠道菌群的因素一致,强烈暗示细菌和噬菌体群落在人体肠道中存在密切关系的可能性。我可以说。

 本研究阐明了人类肠道中噬菌体群落的总体情况,包括新的噬菌体群。预计控制及其应用将导致开发新的疾病治疗方法。

纸张信息:[Nature Communications] 人群水平队列中广泛的肠道病毒组变异及其与宿主和环境因素的关联

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