Kazusa DNA研究所、岛根大学和京都府立大学联合解码了代表樱花的流行品种吉野樱花的基因组。遗传分析使预测开花时间成为可能。
吉野樱花树被认为是 Edohigan 和 Prunus speciosa 之间的种间杂种。它通过扦插等方法进行克隆和繁殖，不仅在日本而且在世界各地都有种植。预测吉野樱花的开花日期对旅游业来说非常重要，但很少对开花进行分子生物学分析。 原因之一是基因组结构复杂，因为它有两个基因组，不容易分析基因组和基因。
在 Kazusa DNA 研究所，我们分析了种植在上野 Onshi Park 的吉野樱花树的基因组，分析了岛根大学拥有的 139 个品种（SNP 分析），并创建了基因预测和连锁图。此外，岛根大学和京都府立大学共同寻找与开花有关的基因。
结果，被普遍接受的吉野樱花树发现了江户彼岸和大岛樱花作为祖先的可能性。它的基因组结构与其近缘物种樱桃、桃子和海胆非常相似。据估计，吉野樱的两个祖先种在2万年前被分离成不同的物种，人们认为吉野樱诞生于一百零几十年前这两个物种通过交叉重聚时。我们分析了开花前一年（每 552 个月）和开花前 2 个月（每 1 天）的芽转录本，并阐明了吉野樱花盛开之前基因表达的变化。
这将实现吉野樱桃祖先的准确识别、开花日期的准确预测以及新品种的开发。研究结果将发表在 Kazusa DNA 研究所运营的 DBcherry 数据库中。
