由京都大学生命科学研究科研究员 Naoyuki Fuse 和理学研究生院教授 Kiyokazu Agata 领导的研究小组通过分析基因组,成功缩小了与环境适应相关的基因组序列的黑蝇。我们正在接近环境适应的机制。这是与国立遗传学研究所共同研究的结果。
在京都大学,果蝇从 1954 年开始在黑暗中进行了 61 代的亚培养,历时 1500 年,被称为“黑蝇”。外观与普通的野生型果蝇相同,但据说它适应黑暗,因为它比野生型果蝇以优势方式将后代留在黑暗的地方。基因组序列的一个碱基不同的现象称为单核苷酸多态性(SNP),它被认为是产生多样性的一个因素。在以前的研究中,确定了黑蝇的整个基因组序列,大约有1鉴定了 1 个 SNP。然而,尚不清楚哪些 SNP 参与了暗适应。
这一次,我们成功地在明亮和黑暗的地方混合了暗蝇和野生型蝇。预计重复传代将混合两个基因组并增加在黑暗种群中参与暗适应的 SNP 的频率。通过基因组分析检测暗蝇SNP频率变化时,约6%的基因组序列在暗条件下被筛选出来,84个基因被确定为参与暗适应的候选基因。它包含与嗅觉和昼夜节律相关的基因。
除了列出“黑蝇”环境适应候选基因的结果外,还展示了在不同环境下混合种群传代缩小环境适应基因组序列的实验实例,用于环境适应研究。方法。未来,我们希望通过整合黑果蝇基因表达分析和基因组分析的结果来识别适应性基因,并通过将黑果蝇SNP引入野生型果蝇基因组来验证黑果蝇SNP的作用。...显然 ...