包括理化学研究所和东京大学在内的大型国际合作研究小组ICGC/TCGA全基因组泛癌分析联盟,对癌症基因组信息进行了迄今为止最全面、最详细的分析,并报告了结果。 对 38 种癌症的 2800 多例全基因组序列分析揭示了超过 4600 万个突变/异常及其特征。

 这项研究是作为“全球癌症类型分析项目 (PCAWG)”的一部分进行的,该项目于 2014 年通过国际合作启动。该项目涉及来自 37 个国家的 1300 多名科学家、IT 工程师和临床医生,致力于对癌症进行前所未有的大规模全基因组测序分析。

 众所周知,在癌症全基因组序列分析中,根据分析算法(流水线)的不同,即使是相同的数据,结果也不同。因此,PCAWG 构建了一个高度准确和标准化的突变识别算法,它结合了三个基本管道。据此,我们分析了ICGC(国际癌症基因组联盟)和TCGA(癌症基因组图谱项目)收集的38种癌症的2834例全基因组序列数据。

 由于总序列数据约1PB(1000万亿字节),数据在云端与全球10台超级计算机共享,包括东京大学医学科学研究所的超级计算机“SHIROKANE”,以及庞大的虚拟数据。是在中心完成的。结果,共鉴定出超过4600万个突变/异常,如非编码区突变、基因组结构异常、线粒体基因组异常。此外,通过分析 16 个工作组中已识别的突变信息并阐明其各种特征,我们能够创建迄今为止最全面、最详细的癌症基因组图谱。

 据称,PCAWG中的全基因组数据和开发的分析方法已向全球公众开放,有望成为下一代癌症基因组医学和研究的数据库。

参考:[RIKEN] 通过国际合作大规模分析整个癌症基因组-为构建下一代癌症基因组医学分析平台做出贡献-

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