大阪大学医学研究科和滋贺大学数据科学部的联合研究小组开发了一种新的数学分析方法,将基因表达水平和DNA甲基化修饰数据相结合,成为食道癌细胞的抗癌药物. 我们已经确定了影响疗效的新基因。

 最近的癌症研究表明,异常基因表达和 DNA 甲基化修饰会影响癌症的形成和进展。例如,在胃癌细胞中,已知一种名为NKX6-1的基因在感染幽门螺杆菌后会引起异常甲基化,从而导致癌症复发。因此,已知异常基因表达和甲基化修饰影响癌症的恶性程度,但所有基因(约22000个基因)的表达水平和甲基化修饰水平的数据量因海量数据而被整合分析。困难至今。

 这一次,研究小组开发了一种新的数学分析方法,可以对基因表达水平和DNA甲基化数据进行综合分析。以每年夺去1万人生命的“食道癌”为中心,通过数学分析方法对人类食道癌细胞数据进行分析,发现基因表达水平升高,而专门针对食道癌的甲基化修饰量减少。我们成功鉴定出新基因 TRAF4。此外,澄清了该基因是调节食道癌作为抗癌药物的功效的基因。

 未来通过对其他癌症进行类似的分析,预计可以确定影响抗癌药物在各种癌症中疗效的基因。

纸张信息:[科学报告] 计算跨组学方法表征了甲基组和转录组的参与,并确定了胃肠癌干细胞化学抗性的新治疗靶点

大阪大学

每个人的“真正价值”成为大阪大学的“进化”。一所生活在社区并延伸到世界的大学

大阪大学是一所研究型大学,拥有11个学院和23个系。 自1931年创校以来,以“居于地域,通达世界”为座右铭,打造了以先进的教育和研究能力、教职工的和谐、传统的重量和大阪的优势。我有。利用这些优秀的潜力 […]

滋贺大学

从“琵琶湖世界琵琶湖宇宙”开启与世界的联系

140多年来,我们一直在传统的支持下培养具有丰富人性和全球视野的高度专业化的专业人才。 数据科学学院于2017年新成立。我们通过以企业问题为基础的合作研究,进行价值创造等各种研究,并正在向文化与科学相结合的大学转型。那[…]

大学学报在线编辑部

这是大学学报的在线编辑部。
文章由对大学和教育具有高水平知识和兴趣的编辑人员撰写。